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物种/ DNA条形码

物种和DNA条形码是使用相同序列数据的独特项目。因此,可以通过序列的收集和系统发育分析来对两个目标进行推断。

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棕色藻类的分类学非常毫无消声,并且在物种事件方面有很多待研究。了解褐藻的进化史将帮助我们更好地分类藻类,了解藻类海洋盆地之间的运动,从单细胞到多细胞的转变,流动制度对发展的影响。对品种事件的研究通常需要多个基因区域能够制定关于物种事件的推论。

DNA条形码

DNA条形码已成功用于红色,绿色和一些棕色藻类的研究中。 DNA条形码是一种短基因区域,一旦测序,就会发出澄清的物种身份。选择以分子代替形态变异的物种避免了由于表型可塑性的高速率而避免了错误识别的问题。有效的DNA条形码约为700个碱基对,并聚焦在一个或部分基因区域上。

Brian analyzes a gel.艾森尼亚植物园

海带森林是世界各地的温带皮质社区的非常富有成效的生态系统。过去的研究表明,浅层和深阴核区域之间的水流和流体动力压力差异可以塑造藻类形态。 艾森尼亚植物园 是海藻物种的一个例子,其中加利福尼亚加州加州岛附近的浅层阴性和深阴影区中的群体,各自具有明显的形态。形态学分化是由表型可塑性或遗传差异仍然不清楚的。本研究的目标是确定这些人群是否仍然是一个适应两个不同环境的物种,或者已经充分多样化,被认为是两个不同的物种。从这两个阴性群中收集样品,并从所有样品中提取DNA。基于来自总基因组DNA提取的多糖含量的差异;这两种种群之间的变化很明显。两个基因区,一个核(LSU [Z片段]的5'核(5'末端[Z片段]和一个线粒体(COX1 5')被扩增并测序。LSU Z片段的系统发育分析 Cox 1 5' 基因区域显示出大量的遗传变异。两者都显示出作为DNA条形码/标记的承诺,以区分浅层或深层种群的个体。两种群体的进一步测序和系统发育分析将进行令人兴奋的结果进行令人兴奋的结果进行。

DNA条形码 Sargassum.

Sargassum. 是最生态的重要和广泛的棕色藻类之一。该属常用于热带地区热带地区的浮动浮床或大型沿海地站。然而,关于其进化历史和系统发育仍然有很大的发现,但是通过无法识别具有100%精度的物种的进展是阻碍的。识别问题是由于表型可塑性和隐蔽物种的高速率以及对加勒比的缺乏研究 Sargassum. 种类。这在巴拿马沿海地区尤其如此,其中多样性的估计很高,具有许多潜在的未被发现的物种。 DNA条形码的开发 Sargassum. 基于形态学和供应数据的系统发育分析来解决传统鉴定的问题。该项目的目标是到三个基因区域条形编码工具比较,并利用这些数据来促成的分辨率 Sargassum.'phylogyy。获得了来自加勒比海和太平洋在巴拿马地区的21个样本。使用改性的CTAB方法和使用Genomiphi方法扩增的全基因组来提取样品以归档DNA。选择几个基因区域,扩增(例如LSU, RBC.l及其-2)并测序。成功提取了所有21个样品,并归档全基因组扩增的产物以供将来使用。使用新的和GenBank数据的Genus建立单个基因区域的主对齐。系统发育分析产生的最大似然的自举树表现出LSU片段z不具有作为条形码足够变化,以功能。本研究的未来方向将集中在与另一个LSU片段或其他基因区域配对LSU Z. 

ascoseira.

ascoseria. 海藻是一个独特的物种是特有的南极的恶劣条件。与其他棕色藻类命令一样,顺序Ascosierales具有高度未解决的分类。 ascoseira mirabilis. 在具有湍流和安静的流动制度之间表现出不同的形态。无论均匀长度是否差异是由于表型可塑性或自适应进化变化都不清楚。从三个单独的区域收集标本,提取总基因组DNA并扩增其-2和2 RBC.我是在进行的。对准序列并进行系统发育分析。在基因区域中发现了没有足够的变异以确定两种群体之间是否发生了物种。未来的研究将专注于其他几个基因区域以及RADTAG分析。